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Claude 連跑 64 小時設計出 17 個蠍毒結合蛋白,但還不是解藥

Anthropic 讓一個內部研究模型自己跑完兩天多的蛋白設計流程,17 個設計在實驗室真的黏上了蠍毒神經毒素。這批分子證明的是「會結合」,離「能救人」還很遠。

陳柏宇陳柏宇
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Claude 連跑 64 小時設計出 17 個蠍毒結合蛋白,但還不是解藥

Anthropic 讓一個內部研究模型自己跑完兩天多的蛋白設計流程,17 個設計在實驗室真的黏上了蠍毒神經毒素。這批分子證明的是「會結合」,離「能救人」還很遠。

Claude 在 64 小時裡做了哪些事

Anthropic 在 10 月 20 日公布一項實驗:讓內部研究模型在 Claude Science 環境裡設計微型結合蛋白(minibinder),靶點是蠍毒裡的神經毒素。專案由 Anthropic 與金融投資研究公司 Citrini Research 共同發起。

人類在這場實驗裡的角色很輕。研究團隊只給了一個初始提示,之後追加四次追問。剩下的 64 小時,模型大部分時間自己跑,分析資料、畫圖表、起草最終報告,人類在旁邊看著。

規模攤開來看更清楚。它呼叫 12 種設計工具,產出 318,484 個蛋白設計。接著折疊並篩選 553,052 組設計與毒素的配對,燒掉約 10,000 GPU 小時。最後它自己挑了 180 個送測,團隊補 31 個,一共 211 個交給實驗室。

這段流程跟 8 月那次單一提示的蛋白設計不同。那次是一次問答,這次是多輪、長時程、讓模型自己決定下一步的完整專案。

17 個命中是怎麼篩出來的

把關的是兩家受託研究機構。Adaptyv Bio 用無細胞體系測,Twist Bioscience 用人的腎細胞表現、加上 Fc 融合,兩邊都用 SPR 看結合訊號。

Anthropic 的過關條件寫得很硬:兩家實驗室都要有訊號,每個重複都要有,解離常數 KD 不超過 1 微莫耳(µM),而且對無關蛋白 CLEC12A 不能有反應。四道同時成立,才算一個命中。

結果是 17 個。Cn2 拿下 7 個,是最大宗。AaH II 與 AaH I 各 4 個,LqhIII 只有 2 個。這五種毒素來自四個地區:墨西哥、巴西、北非與中東。設計瞄準的是毒素與鈉通道接上的位置。針對 Ts1 的設計掛零,多毒素設計也全軍覆沒,沒有一個能同時抓住兩種以上的毒素。

命中率不算神奇。60 個單毒素設計裡有 11 個過關,大約 18%,跟一般蛋白設計專案差不多。有意思的是最強的兩個,Cn2-B1 與 Cn2-B2,對 Cn2 的親和力(binding affinity)已經到個位數奈莫耳。競爭實驗顯示,它們很可能跟已知的中和抗體搶同一個位點。

Anthropic 為什麼挑蠍毒

全球每年有超過 120 萬人被蠍子螫傷,死亡超過 3,250 人,多數是醫療資源不足地區的小孩。這個題目被列為被忽視的熱帶病。

現行療法靠馬匹免疫:把毒素打進馬身上,等牠產生抗體,再純化。整個流程要幾個月,能處理的毒素種類有限,價格也不便宜。用模型先篩出候選結合蛋白,理論上可以把這段時間壓縮。

Claude 的抗毒血清邊界在哪?

這段必須說清楚。17 個設計只通過結合測試,沒有在細胞環境驗證中和作用,也沒有動物實驗。Anthropic 明確表示不聲稱做出了抗毒血清。

從結合成為藥物,還要過細胞、小鼠、安全性、可製造性與可負擔性好幾道關。西班牙國家癌症研究中心的 Susana Vázquez Torres 稱這是「有希望的第一步」,丹麥科技大學的 Timothy P. Jenkins 認為這是 AI 驅動藥物發現的範例轉變。兩人都補了一句:路還很長。

211 個設計與資料全部公開

Anthropic 把 211 個設計與實驗資料放上 Hugging Face(Anthropic/scorpion-toxin-binder-design),技術報告同步公開。外部團隊可以自己重跑,自己挑毛病。

這也是這次實驗最值得看的地方。模型不是被證明會設計蛋白,而是被證明能連續工作兩天、在中途自己換策略,最後交出一份人類看得懂的報告。實驗室外面的驗證才剛開始。

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